Identificación de una secuencia parcial del gen NPR1 en Persea americana var hass “paltoâ€
Resumen
El gen NPR1, denominado también NIM1 (noninducibleimmunity 1), codifica una proteína involucrada en Resistencia Sistémica Adquirida (SAR), resistencia de amplio espectro, en plantas que sobre expresan una batería de genes (PR) relacionadas a patogénesis. NPR1 es un regulador en la ruta de transducción de señales que inducen el SAR. Investigaciones respecto al secuenciamiento de regiones de este gen en cultivo de palto son nulos. Por tal motivo, se identificó una secuencia parcial del gen NPR1 de Persea americana var hass “paltoâ€. Para el efecto, se extrajo el ADN de hojas tiernas de 43 individuos, se determinó la calidad de éste mediante espectrofotometría y electroforesis, se realizó la amplificación del ADN utilizando el juego de primers NPR1-R1, NPR1-L2 y 18S, se secuenciaron los fragmentos amplificados y finalmente se comparó con la de otras especies mediante el análisis en BLAST. Los resultados mostraron una calidad del ADN comprendida entre un valor de 1.4 y 2.6 (A260/A280), siendo 25 muestras las que presentaron valores comprendidos en el rango óptimo de 1.7 a 2.0 con bandas electroforéticas definidas. Con respecto a la amplificación del ADN por PCR, se observó amplificación en 31 muestras y 12 no amplificaron. La ausencia de amplificación probablemente sería por lisis ineficiente debido a la elevada concentración de polisacáridos en la muestra o por posibles alteraciones en la secuencia nucleotídica en la región de anillamiento de los primers. En referencia al secuenciamiento, se logró determinar una región parcial del gen NPR1 constituída por 420 pb con 100% de similitud con especies vegetales de importancia económica.
Palabras clave: Persea americana var. Hass, genNPR1, región parcial.
